Register Perkara di pengadilan Agama adalah terdiri dari 16 macam buku register yaitu :
- Register Induk Perkara Gugatan / R1-PA1G
- Register Induk Perkara Permohonan / R1-PA1P
- Register Permohonan Banding / R1-PA2
- Register Permohonan Kasasi / R1-PA3
- Register Permohonan Peninjauan Kembali / R1-PA4
- Register Penyitaan Barang Bergerak / R1-PA5
- Register Penyitaan Barang Tidak Bergerak / R1-PA6
- Register Surat Kuasa Khusus / R1-PA7
- Register Eksekusi / R1-PA8
- Register Akte Cerai / R1-PA9
- Register Perkara Jinayah ( Khusus bagi Mahkamah Syariyah di wilayah Aceh Nangroe Darussalam) / R1-PA10
- Register P3HP ( Pertolongan Penyelesaian Pembagian harta Peninggalan) / R1-PA11
- Register Ekonomi Syariah / R1-PA12
- Register Itsbat, Rukyat, Hilal / R1-PA13
- Register Eksekusi Putusan Arbitrase Syariah / R1-PA14
- Register Mediasi / R1-PA15